Какие отличительные симптомы штамма «омикрон»?
По словам Проценко, у «омикрона» нет специфических симптомов, но есть такие, по которым можно понять наличие заболевания. Как отметил в интервью главврач Коммунарки, отличительными симптомами этого штамма можно назвать лихорадку и интоксикацию.
«Симптоматика во многом схожа с ОРВИ — температура, выделения из носа, слабость. Каких-то специфических симптомов, по которым могли бы выделять волны (как исчезновение обоняния), — их почти нет. Это в основном лихорадка, интоксикация», — рассказал Проценко.
Примерное время чтения: 2 минуты
Мутировавший штамм коронавируса «омикрон» можно определить с помощью высокочувствительных ПЦР-тестов, которые есть в ковидных стационарах. Об этом в интервью КП рассказал главный врач больницы № 40 в Коммунарке Денис Проценко
.
По его словам, обычные тест-полоски могут подтвердить только наличие или отсутствие коронавируса, но они не позволяют определить конкретный штамм.
«К сожалению, полуколичественные тест-полоски могут подтвердить только есть или нет коронавируса, но они не позволяют реализовать детекцию штамма. Это можно сделать только на специальном оборудовании, с одной стороны. С другой стороны, мониторинг за последние месяцы демонстрирует, что около 85% штаммов, которые мы верифицируем, — это штаммы “омикрон”, поэтому вероятность очень высока в том, что, скорее всего, это будет “омикрон”, исходя из тех статистических наблюдений, которые были сделаны за последние месяцы», — сказал Проценко.
Примерное время чтения: 1 минута
Еженедельник «Аргументы и Факты» № 48. Недешёвая помощь 01/12/2021
Как учёные узнают о том, что возник новый штамм вируса?
Отвечает заведующий лабораторией молекулярной вирусологии НИИ гриппа им. Смородинцева Андрей Комиссаров
:
– Для этого есть специальные технологии расшифровки генома. Плюс разные приборы, которые позволяют это сделать и за один цикл изучить от 1 до 384 вариантов коронавируса. Исследование одного генома обходится в 6–10 тыс. руб. Расчёты Европейского центра по контролю за заболеваниями показывают: чтобы при 2,5 тыс. новых случаев заболевания в день с 95%-ной вероятностью выявить новый вариант коронавируса (которым в настоящий момент болеет не менее 10% от общего числа пациентов с ковидом), необходимо генетически исследовать по 29 образцов вируса в день. Позволить себе это могут не все страны. Абсолютные лидеры – Великобритания и США. В каждой из них расшифровано уже 1 млн геномов. В Великобритании время от сбора биоматериалов до получения результата составляет в среднем 7 дней. Для сравнения: в России для этого требуется от 7 до 40 дней, а в некоторых регионах информация отстаёт от актуальной на несколько месяцев.
Примерное время чтения: 1 минута
Сюжет Пандемия коронавируса нового типа, распространившегося из Китая
Москва, 27 ноября — АиФ-Москва.
ПЦР-тесты распознают новый штамм коронавируса B.1.529, получивший название Омикрон, передаёт ТАСС
заявление Всемирной организации здравоохранения.
«Существующие средства ПЦР-диагностики продолжают выявлять этот вариант», — заявили в ВОЗ.
Отмечается, что один из широко используемых ПЦР-тестов не помогает выявлять «один из целевых генов» и таким образом является маркером присутствия новой мутации.
Подчёркивается, что при использовании данного подхода новый штамм можно обнаружить быстрее, чем это происходило при тестировании во время предыдущих вспышек COVID-19.
Новый штамм коронавируса был обнаружен в Ботсване, ЮАР, Гонконге и Бельгии
. В России его пока не выявили.
По данным ВОЗ, у нового штамма выявлен потенциал к более быстрому распространению. По словам британских учёных, Омикрон является более заразным и устойчивым к существующим вакцинам штаммом, чем известные варианты SARS-CoV-2.
Во Всемирной организации здравоохранения классифицировали
новый вариант коронавируса B.1.1.529 как вызывающий беспокойство.
Самое интересное в соцсетях
Вирусолог объяснил, как определяют штамм коронавируса
Вирусолог Альтштейн: «омикрон»-штамм охватит всю Россию на следующей неделе
Тестирование на наличие определенного штамма коронавируса, как в случае с «омикроном», проводят для того, чтобы определить, может ли он вызвать новую волну заболеваемости. И исследования говорят, что «омикрон» вскоре будет доминировать в России, рассказал «360» профессор Центра имени Гамалеи, вирусолог Анатолий Альтштейн.
«Если в мире уже обнаружен какой-то штамм, который обладает специальными свойствами, то нам, для того чтобы понимать, что будет происходить, нужно уметь этот штамм идентифицировать», — пояснил ученый.
Есть два подхода к идентификации штамма. Можно сделать специальную тест-систему (ПЦР) на тот или иной штамм. Также можно сделать комбинированную систему, которая будет идентифицировать сразу несколько определенных штаммов.
«Но самый лучший способ отличить один штамм от другого — это геномное секвенирование. Это когда вы определяете последовательность нуклеотидов. Это сейчас делается довольно быстро, за пару дней, но нужно специальное оборудование. Таких лабораторий не много, у нас в стране этим занимается Роспотребнадзор, в Санкт-Петербурге есть специальный центр, в некоторых научных центрах», — объяснил Альтштейн.
Геномное секвенирование позволяет достаточно быстро определить вариант вируса.
«Когда же эпидемия уже началась, то тут особенно ничего определять не нужно. Потому что когда у вас идет тот или иной штамм, уже любой врач скажет, что это „омикрон“», — сказал вирусолог.
При эпидемии, вызываемой определенным штаммом, вначале он составляет какой-то процент от других. Перед этим так же следили за «дельтой», теперь — «омикрон».
«Вот сейчас начнется повышение заболеваемости, такое, относительно резкое. Несколько дней происходит повышение не очень большое, а потом поднимается значительно, для „омикрона“ это характерно. И вот тут становится ясно, что главный ведущий штамм — это „омикрон“», — отметил ученый.
Альтштейн предрек, что уже очень скоро «омикрон» распространится по всей стране.
«Я думаю, что уже на следующей неделе „омикрон“ завоюет всю Россию», — сказал он.
Ранее глава Центра имени Гамалеи Александр Гинцбург сообщал, что доля «омикрона»
среди заболевших ковидом в Москве на начало недели составила 30%.
Коронавирус в России и в мире
Много мутаций и высокая заразность. Что известно о «пироле» — новом варианте «омикрона»
Профессор Альтштейн: подштамм «пирола» не обладает страшными свойствами
Летом по миру стал распространяться очередной вариант штамма «омикрона» под названием «пирола». Врачи заявили, что этот патоген приобрел более 30 мутаций и стал намного заразнее. «360» узнал, что представляет собой новое ответвление омикрон-штамма, насколько оно опасно и как не заболеть.
Новый вариант омикрон-штамма «пирола» — что это такое
В середине августа Всемирная организация здравоохранения объявила, что перевела подштамм «омикрона» «пиролу» (BA.2.86) в разряд «варианта под наблюдением». В его генетическом коде выявили высокое число мутаций — на 34 больше, чем у самого «омикрона», и на 36 больше, чем у «кракена», сообщили ученые
.
«BA.2.86 — самый поразительный вариант SARS-CoV-2, который мир наблюдал с момента появления „омикрона“», — сказал Франсуа Баллу, биолог и директор Института генетики Университетского колледжа Лондона (Великобритания).
По словам исследователей, «пирола» распространяется по миру уже несколько месяцев. Впервые этот подштамм выявили в конце июля в Дании, а теперь он присутствует в 20 странах
. Больше всего заразившихся на сегодня — в Великобритании (как минимум 52 человека).
В Дании «пиролу» обнаружили у 17 жителей, в Швеции — у 16, Испании — у 10, во Франции — у девяти. Американские медики зарегистрировали как минимум 19 случаев заражения.
То, что новый вариант имеет большое количество мутаций и намного заразнее
по сравнению с самим «омикроном», и есть его главное отличие. Об этом «360» рассказал российский вирусолог, доктор медицинских наук и профессор НИЦ эпидемиологии и микробиологии имени Н. Ф. Гамалеи Анатолий Альтштейн.
«Скорее всего, этот вариант возник в организме у человека с ослабленным иммунитетом и долго там размножался. Считается, что цифры в научном названии подштамма — BA.2.86 — говорят о том, что это 86-я генерация этого штамма», — отметил ученый.
Медик в красной зоне
Профессор напомнил, что «омикрон» сформировался в 2021 году в организме человека, у которого был СПИД. Длительное размножение в «среде» без иммунитета позволяет вирусам приобретать новые мутации и черты. В случае с «омикроном» — это исключительная заразность и высокая патогенность.
Альтштейн предположил, что «пирола» в скором времени появится во многих странах.
Сказать, будто мы уже хорошо понимаем, что представляет собой этот вирус, пока трудно. Но заявить, что «пирола» обладает какими-то страшными свойствами, нельзя.
российский вирусолог, профессор
К тому же, несмотря на высокую заразность, скорость распространения «пиролы» не такая большая. Летальных исходов среди заразившихся BA.2.86 тоже не зафиксировали
«За эти три месяца существования подштамм не охватил мир, в отличие от „омикрона“, который за короткий промежуток времени распространился по многим странам. У „пиролы“ такого нет», — добавил доктор медицинских наук.
Однако доктор биологических наук, главный научный сотрудник и профессор Института молекулярной биологии имени В. А. Энгельгардта Петр Чумаков уточнил в разговоре с «360» что «пирола» распространяется намного быстрее, чем предыдущие варианты, например «эрис». Тем не менее патогенность практически не изменилась.
Симптомы подштамма «пирола»
Вирусологи пока не выявили специфических симптомов у пациентов, зараженных «пиролой». По словам терапевта Ольги Мининой, признаки заболевания в общих чертах остались прежними:
- кашель;
- температура;
- слабость;
- одышка, боль в груди;
- чихание;
- потеря обоняния и вкуса.
«Пирола» размножается в носоглотке и верхних дыхательных путях, не проникая в легкие, добавил Петр Чумаков. Этот подштамм не приводит к развитию пневмонии так что его легко спутать с простудой.
Помимо этого, Роспотребнадзор отнес
к возможным симптомам BA.2.86 озноб, снижение аппетита, проблемы со стулом, тошноту, рвоту, заложенность носа и затрудненное дыхание.
Определить по каким-то внешним признакам, что человек «подхватил» именно «пиролу», нельзя. Только специальный тест поможет узнать подштамм.
Чумаков допустил, что «пирола» уже проникла в Москву, поэтому в городе с недавних пор наблюдают довольно быстрый прирост заболевших COVID-19. Но официально подтвержденных случаев заражения пока нет. Увеличение числа пациентов можно объяснить «омикроном» или другими его вариантами.
Опасен ли новый подштамм BA.2.86 для человека?
Иммунологи и вирусологи не знают, какими последствиями для здоровья может грозить заражение «пиролой». Что касается вакцин, то разработанные для борьбы с «омикроном» препараты эффективны и против нового подштамма. Создатели вакцин предусмотрели появление новых вариантов SARS-CoV-2,
подчеркнул Альтштейн.
«Сейчас вакцину делают на основе FBP1.5. Состав перекрывает и другие штаммы и их варианты, которые образовались сравнительно недавно», — добавил профессор.
Как не заразиться «пиролой»: пять правил и советы врачей
Правило № 1: мойте руки с мылом
— Одна из важных мер профилактики распространения гриппа и коронавирусной инфекции — гигиена рук;
— Если нет возможности помыть руки с мылом, то следует использовать спиртосодержащие или дезинфицирующие салфетки. Либо продезинфицировать руки с помощью антисептика.
Правило № 2: общение на расстоянии и этикет
— Фраза «соблюдайте дистанцию» звучит в голове на протяжении нескольких лет. Но врачи все-таки советуют избегать мест большого скопления людей, где может поджидать коронавирус;
— COVID-19 передается воздушно-капельным путем. Поэтому на забываем о простом этикете: при кашле или чихании нужно прикрывать рот и нос салфеткой.
Правило № 3: возвращение медицинских масок
Терапевт Ольга Минина напомнила, что защитная медицинская маска — отличный способ уберечь себя от заражения. Ее следует надевать в общественных местах. Даже если сейчас это правило почти никто не соблюдает.
Правило № 4: профилактика
Профессор Чумаков порекомендовал принимать витамины D3, чтобы повысить способность организма сопротивляться вирусным инфекциям.
«Людям, которые заботятся о своем здоровье, следует принимать поливитаминные препараты каждый день. Они общедоступны, а одну пить таблетку, содержащую полный комплекс витаминов, — совсем несложно», — объяснил биолог.
Правило № 5: забота о себе и окружающих
Появление любых симптомов, пхожих на обычный грипп, — верный признак оставаться дома и начинать лечение. Сезонная болезнь, которая неприятна сама по себе, на самом деле может оказаться COVID-19.
«Если вдруг понимаете, что чувствуете себя плохо, то оставайтесь дома и не заражайте других людей. Вызовите на дом врача», — подытожила терапевт.
Коронавирус в Московской области
Коронавирус в Москве
Коронавирус COVID-19 ввел корректировки в жизнь каждого человека. Даже спустя время ежедневно во всем мире обновляются рекорды заражения вирусной инфекцией. Кто-то болел единожды, кто-то прочувствовал на себе симптомы коронавируса несколько раз. Но только мы привыкли к классическому проявлению COVID-19, как он трансформировался в новый штамм — омикрон, симптомы которого несколько отличаются от привычного ковида. В чем их особенность, рассказываем в этой статье.
Что такое омикрон?
Омикрон — это новый штамм коронавирусной инфекции, который отличается от предыдущих вариантов 50 мутациями. Впервые он был выявлен в ноябре 2021 года в ЮАР, а сегодня зафиксирован в 77 государствах. Кто-то из ученых считает, что новый вирус завершает пандемию, а кто-то предсказывает в дальнейшем еще более серьезные мутации.
Омикрон отличается менее агрессивным течением заболевания, но более высоким уровнем контагиозности. Например, если носитель дельты мог заразить до 6 человек, то при омикроне это число возрастает в 2 раза!
Как только новый вирус попадает в организм человека, он начинает размножаться в носоглотке и ротоглотке, а также в бронхах в 70 раз оперативнее, чем при дельте. Это значит, что омикрон крайне быстро достигает клинических проявлений и способности заражать другие организмы. Еще одна его особенность — он легко проникает в верхние дыхательные пути и крайне редко поражает легкие.
Вероятность тяжелого течения среди взрослого человека на 34% ниже, чем при заболевании штаммом дельта. Ярче клинические признаки наблюдается у детей до трех лет. Поэтому если ребенок заболел, необходимо обязательно обратиться за консультацией к педиатру.
Откуда возник омикрон? Есть несколько версий. Одни считают, что новый штамм сформировался в организме человека с сильно ослабленным иммунитетом. Другие — что причина тому — массовая вакцинация.
Какие признаки и симптомы омикрона самые популярные?
Самый распространенный, но менее информативный симптом омикрона — боль в горле, который часто идет в комплекте с першением и кашлем. Стоит отметить, что популярные для коронавируса признаки в виде потери обоняния и вкусов не характерны для омикрона. Чаще болеющие новым штаммов жалуются на головную боль, ломоту в мышцах, насморк, заложенность носа и отсутствие аппетита.
Повышение температуры сложно отнести к явному симптому омикрона, так как она довольно часто меняется. Например, те, кто привиты, могут и не почувствовать какие-либо изменения в этом плане. Некоторые отмечают повышение температуры до 38⁰С и выше, которое приходит в норму после приема жаропонижающего, что нехарактерно для дельты. Насторожить должны и показатели сатурации. Если она снизилась до 94% и ниже, то стоит обратиться к врачу.
По неофициальной информации, одним из диагностических признаков омикрона у взрослых считают конъюнктивит, который сопровождается насморком.
Однако не стоит все перечисленные симптомы относить только лишь к омикрону. Кроме него по прежнему распространены нарушения в области желудочно-кишечного тракта. Те же боли в животе в определенной области, общее недомогание, жидкий стул, повышение температуры могут указывать на пищевое отравление либо аппендицит. Поэтому, если вы не отмечаете у себя боль в горле и глазах, но отметили повышение температуры и неприятные ощущения в животе, то обратитесь к специалисту.
Один из особых признаков коронавируса омикрон — уникальный состав спайк-белка. В оболочке вируса формируются “шипы”, которые напоминают корону. При помощи них инфекция крепится к клеткам, что приводит к инфицированию организма. Именно к этому белку у человека вырабатывается иммунитет после болезни или проведенной вакцинации. Любые изменения в структуре повышают устойчивость вируса к иммунитету. В этой связи, стоит понимать, что штамм омикрон более сильный по сравнению с другими вариациями коронавируса, поэтому человек может заразиться им даже, если недавно переболел другим штаммом.
Новый вирус отличается высокой степенью заболеваемости среди детей и подростков, в отличие от других форматов коронавируса.
Омикрон у детей
Крайне сложно выделить специфические симптомы омикрона у взрослых, в частности, различия у женщин и мужчин. Более информативные сведения о возрастных признаках. Тяжелее переносят заболевание дети, пожилые люди и лица, у которых есть хронические заболевания.
Педиатры настоятельно рекомендуют отслеживать любые изменения в детском организме, особенно, что касается дыхательной и сердечной недостаточности. Если у ребенка наблюдается одышка и учащенное дыхание, он жалуется на боль в межреберьях, то необходимо срочно обратиться к врачу.
Желательно детям и подросткам, так как они относятся к категории не вакцинированной, свести к минимуму общение с потенциальными носителями, нахождение в местах массового скопления людей, при невозможности — надевать маски или респираторы.
Какие анализы подтверждают симптомы коронавируса омикрон?
Омикрон определяется довольно просто. Так как это один из вариантов коронавируса, то выявляется он точно также, как и другие виды: через ПЦР-тест
. Для этих целей берется мазок из носоглотки и ротоглотки.
Исходя из практических наблюдений, ученые сделали вывод, что ПЦР даст положительный результат в конце инкубационного периода. При омикроне у взрослых он составляет до 6 дней. Имейте в виду, что тест может выявить коронавирус до первых симптомов омикрона. Поэтому если вы находились в одном помещении с человеком, у которого были признаки ОРВИ, то целесообразно спустя 72 часа сдать ПЦР. Своевременное выявление инфекции позво
Если признаки омикрона подтвердились исследованием, то врач назначает лечение, формат которого зависит от возраста пациента и его общего состояния здоровья, риска возникновения осложнений. Для доктора не принципиально знать, какой штамм вируса у больного, так как лечение в обоих случаях схоже.
Более точная информация нужна более для статистики и проведения исследований. Для этих целей проводят изучение генома вируса или его фрагмента в лабораторных условиях, которое называется секвенирование. Определив присутствие важных мутаций, можно идентифицировать сам омикрон. На сегодняшний день разработано специальное тестирование для оперативного определения нового штамма, которое будет активно применяется после прохождения регистрации. В домашних условиях определить конкретный вариант коронавируса пока невозможно.
Категорически не рекомендуется заниматься самолечением и начинать пить таблетки, которые вы привыкли принимать во время простуды. Например. омикрон не воспринимает антибиотики, а бесконтрольный прием препаратов такого профиля нарушает микрофлору, снижает защитные возможности организма. Тромболитические препараты необходимо принимать также только по назначению врача, так как в случае неверной дозировки или вида лекарства может возникнуть сердцебиение и внутреннее кровотечение.
Защитит ли вакцина от признаков штамма омикрон?
При полной вакцинации спутником V отмечается: антитела нейтрализуют омикрон чуть слабее, чем другие вариации коронавируса. Тем не менее, полностью вирус не ускользает от вакцины, поэтому она тем не менее обеспечивает защиту разной степени эффективности против всех известных видов коронавируса. Важно понимать, что вакцина не обеспечивает 100% отсутствие симптомов нового штамма коронавируса омикрон. Она облегчает течение заболевания, уменьшает риск развития осложнений и постковидного синдрома.
А что можно сказать о “Спутник Лайт”? Чаще всего ее используют как бустерную вакцину. Это значит, что вводимые вещества запускают те иммунные реакции, которые позволяют сформировать продолжительный иммунитет против омикрона.
Опираясь на опыт стран, где уже прошел пик заболеваемости новым штаммом, можно утверждать, что все утвержденные вакцины защищают организм человека от заболевания коронавирусом в тяжелой форме, в большинстве случаев отпадает необходимость госпитализации. Например, вероятность попасть в больницу для тех, кто прошел полный курс вакцинации, уменьшается в 5 раз, чем у непривитых.
Как защититься и избежать симптомов омикрона
Учитывая тот факт, что омикрон считается наиболее заразным вариантом коронавируса, профилактические меры в данном случае важны как никогда. В качестве общих рекомендаций врачи советуют проходить ревакцинацию каждые полгода и ориентироваться не на уровень антител, а на даты в календаре.
Новорожденного малыша и ребенка в первые годы может защитить вакцинированная мама через грудное молоко, если у нее есть антитела к коронавирусу.
Не стоит забывать про простые и тем не менее эффективные меры:
- носить маски в общественных местах;
- мыть руки;
- использовать антисептики;
- избегать массовые мероприятия и соблюдать социальную дистанцию;
- периодически проветривать помещение и проводить влажную уборку.
Новый штамм коронавируса проще диагностировать и лечить, если вовремя обратить внимание на первые признаки омикрона. Выше мы подробно рассказали о всех признаках, диагностике и лечении. Эта информация поможет встретить вирус “во всеоружии” и вовремя обратиться к врачу.
Анализ позволяет выявить наличие/отсутствие РНК коронавируса SARS-CoV-2 в исследуемом материале с определением генетических вариантов омикрон и дельта.
Тест позволяет с высокой точностью определить штаммы коронавируса омикрон и дельта, а также отличить один вариант от другого по характерным генетическим мутациям в гене S-белка методом полимеразной цепной реакции (ПЦР).
ПЦР является золотым стандартом диагностики COVID-19, обладает очень высокой диагностической чувствительностью – для обнаружения РНК SARS-CoV-2 достаточно минимального количества вирусных частиц в образце.
Коронавирусная инфекция, тест на ковид с определением штамма.
Полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР).
Какой биоматериал можно использовать для исследования?
Мазок из ротоглотки и носоглотки.
Как правильно подготовиться к исследованию?
- Минимум за 1 час до взятия мазков из ротоглотки (зева) не употреблять пищу, не пить, не чистить зубы, не полоскать рот/горло, не жевать жевательную резинку, не курить.
- За 3-4 часа до взятия мазков из носа/носоглотки не закапывать капли/спреи и не промывать нос.
- Исследование не выполняется анонимно, необходимо предъявить паспорт.
Общая информация об исследовании
Всемирная организация здравоохранения в январе 2020 года объявила о чрезвычайной ситуации в области здравоохранения международного значения в связи с распространением коронавируса SARS-CoV-2, который вызывает опасное инфекционное заболевание COVID-19. Все вирусы со временем претерпевают изменения, включая SARS-CoV-2. Когда вирус реплицируется, т.е. создает собственные копии, в его генетическом коде происходят изменения — мутации. Вирус с одной или несколькими новыми мутациями называется вариантом, или штаммом, исходного вируса. Большинство изменений не влияют или практически не влияют на свойства вируса. Однако некоторые изменения могут затрагивать, например, его способность к распространению, связанный с этим уровень контагиозности или эффективность вакцин, терапевтических препаратов, средств диагностики или иных медико-санитарных и социальных мер.
ВОЗ проводит мониторинг и оценку эволюции вируса SARS-CoV-2. Группы исследователей регулярно выполняют секвенирование генома вируса, вызывающего COVID-19, и размещают полученные данные в публичных базах данных, включая ГИСАИД (платформа, которая обеспечивает открытый доступ к геномным последовательностям вирусов гриппа и коронавируса и географическим данным распространения вариантов коронавируса). Такое глобальное сотрудничество позволяет ученым лучше отслеживать мутации вируса. Появление в конце 2020 года новых вариантов вируса, ставших источником повышенного риска для глобального общественного здравоохранения, подтолкнуло к ускоренному проведению классификации отдельных вариантов, вызывающих интерес (ВВИ), и вариантов, вызывающих озабоченность (ВВО). Мониторинг ситуации с распространением коронавируса по всему миру позволяет предоставлять информацию, полезную для нынешнего ведения борьбы с пандемией COVID-19.
На данном этапе применяются маркировочные буквы греческого алфавита для обозначения вариантов коронавируса SARS-CoV-2, вызывающих опасения, — «альфа», «бета», «гамма», – использование которых проще и удобнее для обсуждения в ненаучных аудиториях.
ВОЗ рекомендует всем странам по возможности более активно проводить анализ генетических последовательностей вирусного возбудителя COVID-19 и распространять данные о них для содействия друг другу в мониторинге изменяющейся пандемии и принятии ответных мер.
Вариант дельта (Delta B.1.617.2)
Впервые вариант «дельта» был обнаружен и описан в Индии в октябре 2020. В новом варианте коронавируса выявлены сразу две мутации шиповидного белка (S-белок) – той части вируса, с помощью которой он внедряется в клетки человеческого организма. Ученые выяснили, что это облегчает проникновение в организм вируса SARS-CoV-2 и таким образом способствует заражению. » Дельта» потенциально может и быстрее распространяться. Существует также риск заражения дельта-вариантом как людей, уже перенесших коронавирусную инфекцию, так и тех, кто был вакцинирован. Первоначально эту мутацию коронавируса называли «индийским вариантом». Он имеет сокращенный инкубационный период – порядка 1–3 дней. Данный вариант отличает повышенная по сравнению с другими штаммами вирусная нагрузка, и период выведения возбудителя из организма составляет 13-15 дней, в то время как для предшествующих штаммов он составляет 7-9 дней.
В июне 2021 года в Индии, а позднее и в России, был обнаружен мутировавший вариант «дельты», который известен как вариант AY.1, или «дельта плюс», который отличается наличием в S-белке мутации K417N. Эта мутация позволяет вирусу быстрее связываться с клетками легких человека и способна снижать активность антител у переболевших и вакцинированных людей. Минздрав Индии назвал три отличительных признака «дельты плюс»: повышенная контагиозность, усиленная способность связываться с рецепторами клеток легких и потенциальная устойчивость к терапии моноклональными антителами.
Вариант омикрон (Omicron B.1.1.529)
Впервые штамм Omicron был выявлен в Ботсване и Южно-Африканской Республике в конце ноября 2021 года. В настоящее время он распространился в более чем 100 странах мира. Он значительно отличается от изначального (уханьского) варианта вируса. В нем отмечено большое количество мутаций в S-белке по сравнению со штаммами «альфа», «бета», «гама» и «дельта» COVID-19. В участке гена, кодирующего рецептор связывания, произошло порядка 30 изменений – замен, делеций и вставок аминокислот. Мутации коснулись и других участков генома, ответственных за уклонение от нейтрализующих антител. Есть мнение, что «омикрон» имеет предрасположенность инфицировать ранее вакцинированных и переболевших людей, получивших первичную антигенную последовательность S-белка.
Все эти изменения генетической последовательности привели к изменению свойств вируса: он стал легче передаваться от человека к человеку. Если изначальный вирус SARS-CoV-2 имел R0 (индекс репродукции) 2-5, вариант «дельта» – около 7, то у «омикрона» R0 составляет порядка 10, что характерно для крайне заразных заболеваний. В странах, столкнувшихся с «омикроном», удвоение количества случаев заражения происходило за 2-3 дня. У «омикрона» тропность (привязанность) такая же, как и у предыдущих вариантов вируса, – к рецепторам ангиотензинпревращающего фермента 2 (AПФ2), расположенных в легких, кишечнике, сосудах. По сравнению с предыдущими вариантами, особенно с вариантом «дельта», ученые отмечают более мягкое течение заболевания у ранее переболевших и вакцинированных людей. Однако неиммунное население переносит заболевание без изменений, возможно тяжелое течение.
Позднее был обнаружен подвид «омикрон»-штамма коронавируса под названием BA.2, также известный как «стелс-омикрон», который может проявить себя похожими симптомами.
Быстрое распространение штамма «омикрон» вызывает беспокойство в связи с возможностью совместного циркулирования со штаммом «дельта». Сниженная эффективность вакцин, нестойкость иммунитета после перенесенного заболевания могут иметь серьезные последствия в появлении большого количества заболевших с непредсказуемым течением заболевания. Узнать наверняка, каким вариантом коронавируса заболел пациент, можно, сдав реал-тайм ПЦР-тест.
Для чего используется исследование?
- Быстрый и чувствительный способ диагностики коронавирусной инфекции.
- Позволяет определить штаммы коронавируса – омикрон и дельта – и отличить один вариант от другого по характерным генетическим мутациям в гене S-белка методом полимеразной цепной реакции (ПЦР).
Когда назначается исследование?
- Стандартное исследование при подозрении на ковид.
- Мониторинг эпидемиологической обстановки.
- Скрининг для выявления бессимптомных носителей инфекции.
- Контроль эпидемиологической ситуации на какой-либо территории.
Что означают результаты?
Причины положительного результата:
- наличие COVID-19.
Положительный результат – выявлена РНК SARS-CoV-2. Подтверждает наличие инфекции COVID-19. Указывается выявленный штамм (омикрон или дельта).
Причины отрицательного результата:
- отсутствие коронавирусной инфекции.
Отрицательный результат – РНК SARS-CoV-2 не обнаружена.
- Все пациенты, прибывшие из стран с высоким уровнем распространения COVID-19 или контактировавшие с прибывшими оттуда, а также пациенты с повышенной температурой тела и/или явными симптомами ОРВИ будут направляться для обследования согласно рекомендациям Роспотребнадзора.
- Выявление у пациента какого-либо из штаммов коронавируса в соответствии с существующими клиническими рекомендациями не влияет на тактику лечения.
- Информация о штамме не должна использоваться пациентом в отрыве от рекомендаций лечащего врача.
- Такие факторы, как наличие сопутствующих заболеваний, общее состояние организма, возраст, играют существенно большую роль в развитии тяжести болезни, чем наличие мутаций в геноме патогена, по крайней мере известных на данный момент.
- Использующиеся наборы для проведения исследования демонстрируют высокие показатели аналитической чувствительности, которые позволяют выявить РНК коронавируса даже в инкубационном периоде и у бессимптомных носителей.
Кто назначает исследование?
Инфекционист, педиатр, врач общей практики, анестезиолог-реаниматолог.
- Talha Khan Burki. Omicron variant and booster COVID-19 vaccines. The Lancet. Vol. 10, IS. 2, e17, February 01, 2022.
- ВОЗ. Итоговое заявление о работе десятого совещания Комитета Международных медико‑санитарных правил (2005 г.) по чрезвычайной ситуации в связи с пандемией коронавирусной инфекции (COVID-19). 19 января 2022 г.
- ВОЗ. Отслеживание вариантов вируса SARS-CoV-2.
Анализ позволяет выявить наличие/отсутствие РНК коронавируса SARS-CoV-2 в исследуемом материале с определением генетических вариантов омикрон и дельта.
Тест позволяет с высокой точностью определить штаммы коронавируса омикрон и дельта, а также отличить один вариант от другого по характерным генетическим мутациям в гене S-белка методом полимеразной цепной реакции (ПЦР).
ПЦР является золотым стандартом диагностики COVID-19, обладает очень высокой диагностической чувствительностью – для обнаружения РНК SARS-CoV-2 достаточно минимального количества вирусных частиц в образце.
Коронавирусная инфекция, тест на ковид с определением штамма.
Полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР).
Какой биоматериал можно использовать для исследования?
Мазок из ротоглотки и носоглотки.
Как правильно подготовиться к исследованию?
- Минимум за 1 час до взятия мазков из ротоглотки (зева) не употреблять пищу, не пить, не чистить зубы, не полоскать рот/горло, не жевать жевательную резинку, не курить.
- За 3-4 часа до взятия мазков из носа/носоглотки не закапывать капли/спреи и не промывать нос.
- Исследование не выполняется анонимно, необходимо предъявить паспорт.
Общая информация об исследовании
Всемирная организация здравоохранения в январе 2020 года объявила о чрезвычайной ситуации в области здравоохранения международного значения в связи с распространением коронавируса SARS-CoV-2, который вызывает опасное инфекционное заболевание COVID-19. Все вирусы со временем претерпевают изменения, включая SARS-CoV-2. Когда вирус реплицируется, т.е. создает собственные копии, в его генетическом коде происходят изменения — мутации. Вирус с одной или несколькими новыми мутациями называется вариантом, или штаммом, исходного вируса. Большинство изменений не влияют или практически не влияют на свойства вируса. Однако некоторые изменения могут затрагивать, например, его способность к распространению, связанный с этим уровень контагиозности или эффективность вакцин, терапевтических препаратов, средств диагностики или иных медико-санитарных и социальных мер.
ВОЗ проводит мониторинг и оценку эволюции вируса SARS-CoV-2. Группы исследователей регулярно выполняют секвенирование генома вируса, вызывающего COVID-19, и размещают полученные данные в публичных базах данных, включая ГИСАИД (платформа, которая обеспечивает открытый доступ к геномным последовательностям вирусов гриппа и коронавируса и географическим данным распространения вариантов коронавируса). Такое глобальное сотрудничество позволяет ученым лучше отслеживать мутации вируса. Появление в конце 2020 года новых вариантов вируса, ставших источником повышенного риска для глобального общественного здравоохранения, подтолкнуло к ускоренному проведению классификации отдельных вариантов, вызывающих интерес (ВВИ), и вариантов, вызывающих озабоченность (ВВО). Мониторинг ситуации с распространением коронавируса по всему миру позволяет предоставлять информацию, полезную для нынешнего ведения борьбы с пандемией COVID-19.
На данном этапе применяются маркировочные буквы греческого алфавита для обозначения вариантов коронавируса SARS-CoV-2, вызывающих опасения, — «альфа», «бета», «гамма», – использование которых проще и удобнее для обсуждения в ненаучных аудиториях.
ВОЗ рекомендует всем странам по возможности более активно проводить анализ генетических последовательностей вирусного возбудителя COVID-19 и распространять данные о них для содействия друг другу в мониторинге изменяющейся пандемии и принятии ответных мер.
Вариант дельта (Delta B.1.617.2)
Впервые вариант «дельта» был обнаружен и описан в Индии в октябре 2020. В новом варианте коронавируса выявлены сразу две мутации шиповидного белка (S-белок) – той части вируса, с помощью которой он внедряется в клетки человеческого организма. Ученые выяснили, что это облегчает проникновение в организм вируса SARS-CoV-2 и таким образом способствует заражению. » Дельта» потенциально может и быстрее распространяться. Существует также риск заражения дельта-вариантом как людей, уже перенесших коронавирусную инфекцию, так и тех, кто был вакцинирован. Первоначально эту мутацию коронавируса называли «индийским вариантом». Он имеет сокращенный инкубационный период – порядка 1–3 дней. Данный вариант отличает повышенная по сравнению с другими штаммами вирусная нагрузка, и период выведения возбудителя из организма составляет 13-15 дней, в то время как для предшествующих штаммов он составляет 7-9 дней.
В июне 2021 года в Индии, а позднее и в России, был обнаружен мутировавший вариант «дельты», который известен как вариант AY.1, или «дельта плюс», который отличается наличием в S-белке мутации K417N. Эта мутация позволяет вирусу быстрее связываться с клетками легких человека и способна снижать активность антител у переболевших и вакцинированных людей. Минздрав Индии назвал три отличительных признака «дельты плюс»: повышенная контагиозность, усиленная способность связываться с рецепторами клеток легких и потенциальная устойчивость к терапии моноклональными антителами.
Вариант омикрон (Omicron B.1.1.529)
Впервые штамм Omicron был выявлен в Ботсване и Южно-Африканской Республике в конце ноября 2021 года. В настоящее время он распространился в более чем 100 странах мира. Он значительно отличается от изначального (уханьского) варианта вируса. В нем отмечено большое количество мутаций в S-белке по сравнению со штаммами «альфа», «бета», «гама» и «дельта» COVID-19. В участке гена, кодирующего рецептор связывания, произошло порядка 30 изменений – замен, делеций и вставок аминокислот. Мутации коснулись и других участков генома, ответственных за уклонение от нейтрализующих антител. Есть мнение, что «омикрон» имеет предрасположенность инфицировать ранее вакцинированных и переболевших людей, получивших первичную антигенную последовательность S-белка.
Все эти изменения генетической последовательности привели к изменению свойств вируса: он стал легче передаваться от человека к человеку. Если изначальный вирус SARS-CoV-2 имел R0 (индекс репродукции) 2-5, вариант «дельта» – около 7, то у «омикрона» R0 составляет порядка 10, что характерно для крайне заразных заболеваний. В странах, столкнувшихся с «омикроном», удвоение количества случаев заражения происходило за 2-3 дня. У «омикрона» тропность (привязанность) такая же, как и у предыдущих вариантов вируса, – к рецепторам ангиотензинпревращающего фермента 2 (AПФ2), расположенных в легких, кишечнике, сосудах. По сравнению с предыдущими вариантами, особенно с вариантом «дельта», ученые отмечают более мягкое течение заболевания у ранее переболевших и вакцинированных людей. Однако неиммунное население переносит заболевание без изменений, возможно тяжелое течение.
Позднее был обнаружен подвид «омикрон»-штамма коронавируса под названием BA.2, также известный как «стелс-омикрон», который может проявить себя похожими симптомами.
Быстрое распространение штамма «омикрон» вызывает беспокойство в связи с возможностью совместного циркулирования со штаммом «дельта». Сниженная эффективность вакцин, нестойкость иммунитета после перенесенного заболевания могут иметь серьезные последствия в появлении большого количества заболевших с непредсказуемым течением заболевания. Узнать наверняка, каким вариантом коронавируса заболел пациент, можно, сдав реал-тайм ПЦР-тест.
Для чего используется исследование?
- Быстрый и чувствительный способ диагностики коронавирусной инфекции.
- Позволяет определить штаммы коронавируса – омикрон и дельта – и отличить один вариант от другого по характерным генетическим мутациям в гене S-белка методом полимеразной цепной реакции (ПЦР).
Когда назначается исследование?
- Стандартное исследование при подозрении на ковид.
- Мониторинг эпидемиологической обстановки.
- Скрининг для выявления бессимптомных носителей инфекции.
- Контроль эпидемиологической ситуации на какой-либо территории.
Что означают результаты?
Причины положительного результата:
- наличие COVID-19.
Положительный результат – выявлена РНК SARS-CoV-2. Подтверждает наличие инфекции COVID-19. Указывается выявленный штамм (омикрон или дельта).
Причины отрицательного результата:
- отсутствие коронавирусной инфекции.
Отрицательный результат – РНК SARS-CoV-2 не обнаружена.
- Все пациенты, прибывшие из стран с высоким уровнем распространения COVID-19 или контактировавшие с прибывшими оттуда, а также пациенты с повышенной температурой тела и/или явными симптомами ОРВИ будут направляться для обследования согласно рекомендациям Роспотребнадзора.
- Выявление у пациента какого-либо из штаммов коронавируса в соответствии с существующими клиническими рекомендациями не влияет на тактику лечения.
- Информация о штамме не должна использоваться пациентом в отрыве от рекомендаций лечащего врача.
- Такие факторы, как наличие сопутствующих заболеваний, общее состояние организма, возраст, играют существенно большую роль в развитии тяжести болезни, чем наличие мутаций в геноме патогена, по крайней мере известных на данный момент.
- Использующиеся наборы для проведения исследования демонстрируют высокие показатели аналитической чувствительности, которые позволяют выявить РНК коронавируса даже в инкубационном периоде и у бессимптомных носителей.
Кто назначает исследование?
Инфекционист, педиатр, врач общей практики, анестезиолог-реаниматолог.
- Talha Khan Burki. Omicron variant and booster COVID-19 vaccines. The Lancet. Vol. 10, IS. 2, e17, February 01, 2022.
- ВОЗ. Итоговое заявление о работе десятого совещания Комитета Международных медико‑санитарных правил (2005 г.) по чрезвычайной ситуации в связи с пандемией коронавирусной инфекции (COVID-19). 19 января 2022 г.
- ВОЗ. Отслеживание вариантов вируса SARS-CoV-2.
Когда при коронавирусной инфекции не нужна госпитализация?
Госпитализация не нужна, если нет одышки, нет температуры (выше 37.8) больше трех дней, нет несбиваемой температуры, нет сопутствующих патологий. В такой ситуации можно просто продолжить наблюдение и обратиться за консультацией, говорит Проценко.
Как определяют «омикрон»?
Роспотребнадзор разработал методику, позволяющую определить три линии штамма «омикрон»: BA.1, BA.2 и BA.3. Исследования проводятся методом ПЦР в режиме реального времени. Тестирование позволяет получить результат в течение нескольких часов.
Методологию разработали ученые ЦНИИ Эпидемиологии. Он не только идентифицирует все известные на сегодня варианты «омикрона», но и дифференцирует варианты BA.1 и ВА.2 по трем мутациям del69-70, del143-145 и ins214.
